Pe site-ul FRF a fost afişat următorul program:
Marţi, 27 noiembrie
Petrolul Ploieşti - Concordia Chiajna, ora 20.30, stadion "Ilie Oană" (Ploieşti)
Miercuri, 28 noiembrie
Ceahlăul Piatra Neamţ - Oţelul Galaţi, ora 17.45, stadion "Ceahlăul" (Piatra Neamţ)
CFR Cluj - Dinamo, ora 20.30, stadion "Dr. Constantin Rădulescu" (Cluj)
Joi, 29 noiembrie
Rapid - Astra Giurgiu, ora 20.30, stadion "Giuleşti-Valentin Stănescu" (Bucureşti)
Sferturile de finală se vor desfăşura în sistem eliminatoriu, într-o singură manşă. Conform tragerii la sorţi efectuată la 6 noiembrie, semifinalele vor avea loc în două manşe (12 decembrie 2012, respectiv 17 aprilie 2013), prima echipă extrasă urmând să joace turul pe teren propriu.
Semifinala 1: Ceahlăul Piatra Neamţ/Oţelul Galaţi - Petrolul Ploieşti/Concordia Chiajna
Semifinala 2: CFR Cluj/Dinamo - Rapid/Astra Giurgiu.
Finala Cupei României-Timişoreana se va disputa la 1 iunie 2013. Echipa câştigătoare a semifinalei 1 va fi considerată echipă gazdă în finală.