Havelange s-a aflat la conducerea FIFA din anul 1974 până în anul 1998, apoi a fost ales preşedinte de onoare al forului internaţional.
În raportul de astăzi al Comisiei de Arbitraj din cadrul Comitetului de Etică al FIFA se menţionează că brazilianul, în vârstă de 96 de ani, a părăsit postul său pe 18 aprilie.
În anul 2012, Comitetul de Etică al FIFA a declarat că Havelange şi ginerele său, Ricardo Teixeira, şeful Comitetului de Organizare al CM 2014 din Brazilia, sunt suspectaţi de primirea de mită din partea fostului partener de marketing al FIFA – compania ISL.