Vettel a avut din nou un start senzaţional, poziţia sa de lider nefiind pusă sub semnul întrebării în niciun moment. În schimb, coechipierul său de la Red Bull, australianul Mark Webber, a plecat foarte prost, coborând de pe locul 3 până pe 9. Marele câştigător al debutului cursei a fost germanul Nick Heidfeld, care s-a strecurat până pe poziţia secundă, Lewis Hamilton, Jenson Button şi Vitaly Petrov completând topul primilor cinci.
Cum actualul campion mondial şi-a făcut cursa fără nicio problemă, lucrurile interesante s-au petrecut în lupta pentru celelalte poziţii de pe podium. Jenson Button a condus în propriul ritm, nu a făcut nicio greşeală şi a încheiat pe poziţia secundă, urcând astfel pe locul 2 şi în clasamentul general. Germanul Nick Heidfeld a confirmat începutul bun de cursă şi s-a clasat al treilea, dovedind că rezultatul obţinut la Melbourne de coechipierul său, Vitaly Petrov, nu a fost întâmplător.
Doi foşti campioni mondiali, spaniolul Fernando Alonso şi britanicul Lewis Hamilton, au fost implicaţi într-un incident în turul 46, în urma căruia ambii au pierdut poziţii importante, terminând în cele din urmă pe locurile 6 şi 7, în spatele lui Mark Webber şi a lui Felipe Massa. Top ten-ul a fost completat de japonezul Kamui Kobayashi, germanul Michael Schumacher şi Paul Di Resta, scoţianul de la Force India.
Clasament final MP al Malaysiei
1.Sebastian Vettel (Germania) - Red Bull 1:37:39.832
2.Jenson Button (Marea Britanie) - McLaren +3.261
3.Nick Heidfeld (Germania) - Renault +25.075
4.Mark Webber (Australia) - Red Bull +26.384
5.Felipe Massa (Brazilia) - Ferrari +36.958
6.Fernando Alonso (Spania) - Ferrari +37.248
7.Lewis Hamilton (Marea Britanie) - McLaren +49.957
8.Kamui Kobayashi (Japonia) - Sauber +1:06.439
9.Michael Schumacher (Germania) - Mercedes GP +1:24.896
10.Paul di Resta (Marea Britanie) - Force India +1:31.563
11.Adrian Sutil (Germania) - Force India +1:41.379
12.Nico Rosberg (Germania) - Mercedes GP +1 tur
13.Sebastien Buemi (Elveţia) - Toro Rosso +1 tur
14.Jaime Alguersuari (Spania) - Toro Rosso +1 tur
15.Heikki Kovalainen (Finlanda) - Lotus + 1 tur
16.Timo Glock (Germania) - Virgin + 2 ture
Neclasaţi
Vitaly Petrov (Rusia) - Renault
Jerome d'Ambrosio (Belgia) - Virgin
Jarno Trulli (Italia) - Lotus
Sergio Perez (Mexic) - Sauber
Rubens Barrichello (Brazilia) - Williams
Narain Karthikeyan (India) - Hispania
Pastor Maldonado (Venezuela) - Williams
Clasament general piloţi
1.Sebastian Vettel 50p.
2.Jenson Button 26p.
3.Lewis Hamilton 24p.
4.Mark Webber 22p.
5.Fernando Alonso 20p.
Clasament general echipe
1.Red Bull 72p.
2.McLaren 50p.
3.Ferrari 36p.
4.Renault 30p.
5.Toro Rosso, Sauber, Force India 4p.