În ceea ce priveşte viitorul Bisericii Catolice, Nostradamus nu a fost deloc optimist, însă, legat de viitorul lui Benedict al XVI-lea, la care se crede că ar face referire catrenele 2.97 şi 5.31, pare să se fi înşelat. Nostradamus a prezis, pentru 2012, moartea suveranului pontif. Mai mult decât atât, francezul a făcut referire şi la succesorul lui Benedict, "un bărbat tânăr" care "va obţine o funcţie înaltă" în 2014. Mai mult, potrivit unor interpretări, noul Papă va crea un scandal în Biserica Catolică până în 2017, care va fi stins abia în 2020.
În cartea "Profeţiile complete ale lui Nostradamus", scrisă de Mario Reading, autorul explica unul dintre catrenele profetului francez: "A German heart is born of Troyan blood/ He will wield such power/ That will chase away the foreign Arabs/ Returning the church to her immaculate preeminence" ("O inimă germană se naşte din sânge troian/ Va exercita atâta putere/ încât îi va alunga pe străinii arabi/ Readucând biserica la supremaţia ei imaculată").
"Se pare că Nostradamus a răsucit un cuţit adânc în rană cu această profeţie", scrie Reading. Născut în Marktl am Inn, la numai 12 kilometri distanţă de oraşul de unde era originar Adolf Hitler, fostul cardinal Ratzinger a făcut mai multe referiri de-a lungul timpului la opera unuia dintre cei mai celebri traducători în limba germană ai Coranului, profesorul Adel Theodore Khoury, renumit pentru eforturile sale de temperare a dialogului dintre lumea creştină şi cea musulmană.
"Nostradamus a făcut astfel referire la primul Papă de origine germană care să ofere putere Bisericii Catolice în ceea ce el consideră a fi aspectele extreme şi inacceptabile ale credinţei islamice", mai scrie Mario Reading.
Referiri la Papa Benedict al XVI-lea şi la succesorul său au fost făcute şi de unul dintre cei mai populari sfinţi irlandezi, Sfântul Malachy. Astfel, potrivit profeţiilor lui Malachy, Benedict al XVI-lea, care este al 111-lea suvern pontif, va fi succedat de un papă al cărui pontificat va duce la dispariţia oraşului Roma, acela fiind, de altfel, şi ultimul suvern pontif. Malachy nu oferă însă şi previziuni cu privire la viitorul Bisericii Catolice şi al umanităţii după dispariţia ultimului papă.