După aflarea rezultatelor votului la nivel european, deputații europeni se alătură grupurilor politice în funcție de afinitățile lor politice și ideologice. Pentru a forma un grup politic, este necesar un număr minim de 25 de membri din cel puțin 7 state membre.
Grupurile politice se formează pentru a avea o influență mai mare în Parlament și pentru a coordona activitățile legislative. Fiecare deputat trebuie să declare cărui grup politic dorește să aparțină. Aceasta se întâmplă de obicei în primele zile după anunțarea rezultatelor.
Prima sesiune plenară a noului Parlament este dedicată alegerii președintelui Parlamentului European.
Președintele este ales prin vot secret și trebuie să obțină o majoritate absolută din voturile exprimate. Dacă nu se obține majoritatea absolută în primele trei tururi de vot, în al patrulea tur participă doar cei doi candidați cu cele mai multe voturi din turul precedent, iar candidatul cu cele mai multe voturi este ales.
După alegerea președintelui, Parlamentul alege 14 vicepreședinți și 5 chestori. Vicepreședinții sunt aleși printr-un sistem de vot similar cu cel pentru președinte, iar chestorii sunt responsabili cu aspectele administrative și financiare legate de activitatea deputaților..
După constituirea grupurilor politice și alegerea conducerii, Parlamentul formează comisiile parlamentare. Comisiile sunt structuri specializate care se ocupă de diverse domenii, cum ar fi comerțul internațional, mediu, afaceri economice. membrii comisiilor sunt aleși de grupurile politice în funcție de proporția acestora în Parlament. Fiecare comisie își alege propriul președinte și vicepreședinți.
Odată constituite toate structurile, Parlamentul începe activitatea legislativă propriu-zisă. Deputații lucrează în cadrul comisiilor pentru a pregăti proiecte de legi, pe care le supun apoi votului în plen.