Suspectul reținut, Hiroshi Watanabe, în vârstă de 66 de ani, urmează să fie acuzat de crimă.
Incidentul a debutat joi, în Fujimino, un oraș la nord de Tokyo.
Presa niponă a scris că echipa medicală l-a vizitat pe Watanabe, la cererea acestuia, joi noaptea.
Este vorba de medicii și asistentul care au îngrijit-o pe mama bărbatului, recent decedată.
Poliția, alertată de vecinii care au auzit focuri de armă
Poliția a fost alertată în jurul orei locale 21, după ce vecinii au semnalat focuri de armă la locuința lui Watanabe și au găsit un bărbat sângerând, cu răni în piept și în stomac, în fața casei suspectului.
Rănitul, un asistent medical de 41 de ani, a fost transportat la spital, unde a fost internat în stare critică.
Un alt bărbat a reușit să fugă din casă și să ajungă la o secție de poliție.
Polițiștii care au înconjurat locuința suspectului au luat legătura prin telefon cu acesta, însă Watanabe nu formulat revendicări.
Vineri dimineață, autoritățile au evacuat peste 100 de localnici și au închis școlile din zonă.
Forțele de ordine au pătruns apoi în locuința unde i-au găsit pe Junichi Suzuki, un doctor de 44 de ani, grav rănit, și pe suspect.
Doctorul a murit la spital.
Nu este clar momentan care a fost motivația luării de ostatici.
BBC notează că astfel de incidente sunt relativ rare în Japonia, unde există un control strict al armelor de foc.
Conform unor relatări neconfirmate oficial, suspectul ar fi folosit o pușcă de vânătoare.