În perioada 1958-1964 este închis în lotul legionarilor la Aiud. În perioada 1965-1976 deţine mai multe funcţii în cadrul Arhiepiscopiei misionare ortodoxe din America, perioadă în care primeşte şi rangul de arhimandrit din partea Sfântului Sinod al bisericii ortodoxe. Pe 21 ianuarie 1993, după ce se retrăsese ca duhovnic la Mănăstirea Văratec, a fost ales Arhiepiscop al Vadului, Feleacului şi Clujului.
În 2005 este ales Mitropolit al Clujului, Albei, Crişanei şi Maramureşului, după ce, cu câteva luni înainte, fusese artizanul înfiinţării noii mitropolii în Ardeal. Înalt Prea Sfinţia Sa Batrolomeu este scriitor, dar şi un membru activ al societăţii civile, cunoscută fiind opoziţia sa faţă de exploatarea de la Roşia Montana.
Bartolomeu Anania se bazează pe încrederea Arhiepiscopiilor de Cluj şi Alba-Iulia şi a Episcopiei Maramureşului şi Sătmarului şi pe cea a Oradiei. Totodată, el se bucură şi de sprijinul lui Teofan, mitropolitul Olteniei.
Antena 3